北京中西医结合医院始建于1952年，地处长安街沿线，西四环外200米，位于北京市海淀区永定路东街3号，原名北京市第二疗养院;1956年迁至现址，1959年7月改名为北京市永定路医院;1989年纳入全国第一批中西医结合医院，获批更名为北京市中西医结合医院;1994年，遵循国家中医药发展战略，医院与北京中医药大学实现合作，成为北京中医药大学附属中西医结合医院;1996年医院挂牌全国专科疾病北京中医药治疗中心;2011年启动了博士后工作流动站工作;2016年医院成为国家中医药管理局第三批重点中西医结合医院;2016年11月，通过三级中西医结合医院等级评审，实现了医院跨越式发展。
经过60多年砥砺前行，北京中西医结合医院发展成为一所集医疗、教学、科研、康复为一体，以中西医结合为特色的中西医结合医院。医院拥有国家级重点专科肾内科;北京市级重点专科脑病科、护理专科，市重点学科心内科，北京基层中医药学科团队基地针灸科;海淀区重点专科针灸科、重点学科肾内科、脑病科、针灸科、口腔科、品牌科室脑病科。
医院总占地面积28亩，建筑面积3.3万m2。目前正在进行改扩建，暂分南北两院区运营。医院开放床位402张，现日均门急诊量2200余人次,年门诊量55万余人次，年出院病人6000余人次。建设中的综合楼建筑面积4.3万m2，编制人员1200人，编制床位600张。
医院始终以提高医疗质量和服务水平为目标，以充分发挥中医药特色为优势。现设临床专业科室21个,医技科室11个。全院在职职工669人，其中卫技人员578人，护理人员253人，高级职称74人，中级职称192人，中医、中西医结合临床医师131人，中药学专业23人。
“十年育树，百年树人”，医院始终坚持人才立院，调整人员结构，分层引进优秀中医、中西医结合人才。现有市级名老中医3名，市“双百”工程指导老师1名，国家优秀人才3名，市级高层次人才1名，区级学科带头人5名，区级学科骨干7名。医院于2011年启动了博士后工作流动站。现有硕士109名，博士(博士后)19名，硕士生导师7名，博士生导师2名。
目前，医院在研国家自然基金项目5项，首都发展基金项目3项，中医药科技项目12项，区级项目26项。承担北京中医药大学教学任务30年，共培养本科生近1000名、硕博研究生42名。
医院依托北京丰富的中医医疗资源优势，聘请多位国家级、市级名老中医来院建立学术传承工作室、站7个。代代承袭、薪火相传，现已有国家、市级名老中医传承人19名。
医院重视对外交流，将中医精粹远传到阿尔巴尼亚，并开展对俄医疗服务;以国际教学作为开展外交助院的方式之一，多年承担美国加州中医药大学外国留学生的针灸临床带教，多次成功举办肾病、经方、口腔等国家级继教项目的国际会议。