长春市传染病医院是在长春市结核病医院基础上于2004年组建，位于长吉南线公路与长石公路交汇处，距市中心16公里，占地面积26公顷，建筑面积40957平方米。以防治各类传染病、结核病、应对突发公共卫生事件医疗救治任务为主要功能、集医疗、预防、科研为一体的非营利性三级甲等传染病医疗机构，为省、市医保、新农合定点医院，省级传染病质量控制中心，省级计划免疫接种异常反应处理定点单位，省内唯一一家功能最全、设备最先进、规模最大的传染病医院。
　　医院现有在岗职工415人，专业技术人员328人，享受国务院特殊津贴6人，市政府特殊津贴3人，市级专家4人，正高职称15人，副高职称45人，中级职称162人。医院编制床位450张，开放床位412张，目前最大收容能力可达600张床位。
　　医院科室建制：三个门诊（传染、结核、性病）、八个疗区（传染科疗区、耐多药结核科、中西医结合科、结核病综合疗区、胸外科疗区、胸膜炎疗区、糖尿病合并结核疗区、结核性脑膜炎疗区）、六个医技科室（一个PCR实验室）、一个国家级重点实验室（国家中医中药管理局传染病重点研究室）、一个国家级临床基地（国家中医药管理局防治传染病临床基地）、一个省级重点研究室（吉林省结核病重点研究室）、六个省级中心（吉林省传染病诊疗中心、吉林省传染病质量控制中心、吉林省艾滋病医疗救治中心、吉林省艾滋病临床检验中心、吉林省艾滋病感染控制中心、吉林省结核性脑膜炎研究治疗中心）、三个市级重点专科（结核性脑膜炎研究治疗中心为一类市级重点专科，胸膜炎专科、结核病合并糖尿病科为二类市级重点专科）。
　　医院拥有多排螺旋CT、彩超、数字胃肠机、7180型全自动生化分析仪、结核菌快速检测仪、PCR、流式细胞仪等主要设备50余台件。
　　医院在艾滋病、手足口病、麻疹、流行性出血热等疾病积累了丰富的临床治疗经验，成功地应对了甲型流感、手足口病、麻疹等多种传染病疫情的突发公共卫生事件。
　　医院传染科共收治传染病24种，对麻疹、手足口、艾滋病、流行性出血热、肺炭疽等传染性疾病诊治水平得到省、市高度认可；
　　中西医结合科充分发挥中西医结合防治传染性疾病的特色和优势，在结核病、甲流、手足口病、艾滋病等防控过程中发挥了重要作用；
耐多药结核科是省内唯一一家定点收治耐多药结核病患者的专科，承担全球基金耐多药结核病防治项目；
结核性脑膜炎研究治疗中心是全国首家结核性脑膜炎研究治疗机构，长春市重点扶持的专科之一，在治疗方法和治疗效果方面居国际先进、国内领先水平；
胸膜炎科在多浆膜腔积液的治疗方面达到国内先进水平；
糖尿病科在治疗结核病合并糖尿病方面有独到的治疗经验，技术水平省内领先；
长春市结核病防治所工作成绩斐然，在全省结核病预防控制工作中居上游水平。
医院现有国家级在研课题六项（国家十一五科研重大专项4项、国家中医药管理局行业专项2项）；省级新立项科研课题四项（吉林省中医药管理局科技计划）。
医院开展国际间学术交流。主办了与日本公益财团法人结核预防会、日本结核预防会宫城县支部召开“结核预防及胸部疾病中日友好学术交流”年会；邀请美国阿尔伯特·爱因斯坦医学院卡罗尔·哈里斯教授、美国亚利桑那大学医学院张玉清教授多次来该院开展学术交流及技术合作洽谈事宜，同时该院并通过FAW美国国家联邦认证。
近年来，医院荣获全国医药卫生系统先进集体、省文明单位、省、市精神文明单位，省、市先进基层党组织，“白求恩杯”竞赛最佳单位，“花园式”医院，省卫生厅价格诚信单位、医德建设“标兵单位”，市城乡结对、“三帮扶”工作先进单位等荣誉称号。