我院原名呼和浩特市中蒙医医院(原呼和浩特市中蒙医院)，成立于1962年，是一所以蒙医、中医为主的综合性医疗机构。五十多年来，在党的民族政策的保护和扶持下，医院得到健康的发展。
医院占地130亩，建筑面积8.5万平方米，开放床位700张。现有在职职工901人，其中卫技人员640人，博士学历专业人员10人，硕士学历专业人员90人，自治区名蒙医、名中医7人。享受国务院特殊津贴1人。拥有国家重点专科1个（蒙医五疗科），全国名老中医专家传承工作室2个（温启宗传承工作室、黄海波传承工作室）、自治区重点专科5个（脾胃科、针灸科、脑病科、心病科、蒙医针灸推拿科），市重点专科5个（蒙医肝胆科、蒙医肺病科、治未病中心、老年病科、肾病科）。医院设有蒙、中、西医门诊科室67个，病区12个，医技科室6个。配置有1.5T核磁、64排螺旋CT、血管造影机等大型先进诊疗设备及蒙中医特色治疗设备。
为使我市的民族医药得到更好的继承和弘扬，市委市政府高瞻远瞩，于2012年批准我院的新建项目，并将此项目列为全市重要民生工程和自治区成立70周年献礼工程予以重点支持。新医院建筑面积8.5万平方米，设置床位720张。经4年努力，新医院于2016年12月竣工交付使用，12月28日医院完成整体搬迁，同日更名为呼和浩特市蒙医中医医院。
2017年初，经市政府批准，呼市医养中心建设项目又落户我院。此项目位于医院东北侧，建筑面积约15万平方米，拟设床位1000张，目前已启动项目立项、施工图纸设计、建设资金筹集等工作，预计2018年破土动工。届时，医院无论规模上，还是学科发展上，都将达到自治区领先水平。
新医院开诊4个月来，各项工作渐入正规，病床使用率达到96%，医院以民族医疗特色和优质服务赢得了群众的信任和好评。
我们有理由相信，随着医院学科建设的不断加强和业务工作的日益繁荣，随着医养结合项目的建设和启用，医院将会迎来新一轮的高速发展。奋进中的呼市蒙医中医医院将秉承蒙中医为主、蒙中西医相结合的办院方针，坚持一体两翼发展思路（一体指医疗为主体，两翼指蒙中医医养康复和蒙中医养生保健相配合），为国内外群众提供优质、便捷、价廉、满意的服务。