1964年10月，牙防所在嵩山路成立。从成立伊始，主要承担区域口腔预防保健和口腔疾病诊疗服务。此后，牙防所历经分合,2008年再次独立运营。这是在新的历史时期，进一步满足社会民众口腔健康需求的重大决择，也是牙防人展现专业精神、服务社会发展的新机遇。
　　作为区属二级口腔专科医疗机构，牙防所现有瑞金二路148号，斜土路780号二处服务点，总建筑面积2110平方米，职工68人，卫技人员占比90%，医生学历中本科100%，研究生32%。
　　2011年6月，黄浦、卢湾两区“撤二建一”以来，牙防所进一步优化区域口腔防治一体化工作机制，将斜土路780号分所改建为区域口腔预防保健中心（实训基地）。在保持市级历史文物保护建筑的总体要求下，对瑞金二路148号结合口腔临床诊疗强度和患者服务满意度提升需要，进一步开展了内部环境的美化、绿化和专业服务流程的优化、细化。
　　把握时代赋予牙防人的发展机遇，以专业化、精细化管理的举措助推精品牙防建设是医院发展的共识和努力的目标。
　　一、学用相长提升服务。建立三级学科体系，近年来共立项各级各类课题30项，其中：市级2项，区科委和区卫计委25项，所级3项，在国际国内各类核心期刊发表学术论文、论著计60篇。培养区卫计委学科带头人1名，区骨干人才1名、区卫计委优秀青年人才培养对象2名。学科建设成果已经转化为保持和提升口腔预防诊疗的质量水平的源动力。
　　二、防治结合精准服务。健全特需、专家、专病、普诊四位一体诊疗体系，开设口腔预防保健、口腔综合治疗、口腔修复、口腔正畸、口腔种植、牙体牙髓病、齿槽外科、牙周专病、微创拔牙等专科专病诊疗，提供一门式集约化诊疗服务。强化区域口腔预防保健功能定位，建设区域性口腔预防保健宣传、教育、培训与实操相结合的区域口防实训基地。
　　三、立足专业落实公益。2009年以来，牙防所长期坚持开展口腔修复“四月惠民”，口腔正畸“寒暑假惠学”和“助老助贫”特色公益性诊疗服务。坚持推进口腔专业咨询、保健服务进“社区、校区、营区、园区”专项工作，坚持结合民间重大节庆、重大活动开展专业服务“上楼宇、下街道”专业实践。
　　四、温馨牙防健康之家。倡导“牙防是个家，发展靠大家”理念，集中干群智慧，坚定不移地实施“三满意”工程（职工满意、患者满意、政府满意）。强化一切服务于预防、诊疗一线的工作原则，落实首问、首诊负责制，持续规范运营管理，注重组织文化软实力建设，铸造牙防团队核心竞争力，共同建设温馨、和谐牙防。
　　黄浦区第二牙病防治所先后荣获全国牙病防治先进单位、上海市口腔公共卫生优秀区县、上海市信息安全医院、上海市医疗机构口腔诊疗器械消毒技术操作规范示范单位、上海市医疗废弃物处置示范单位、上海市医保信息安全管理先进单位、上海市卫生系统文明单位、黄浦区文明单位、区“创先争优”先进基层党组织、区先进职工之家等荣誉称号。