建湖县人民医院始建于1948年5月，现为三级乙等综合医院，南通大学附属医院。医院由南北两院区组成，位于城南的南院区占地200亩，建筑面积13万平方米，总投资达8亿多元，2016年正式投入运行，设置床位1000张；位于老城区的北院区占地82亩，建筑面积近8万平方米，依托该院妇、产、儿科，整合妇保所、计生指导站，组建成妇幼保健院，设置床位500张。两院区现有职工1300余人，其中卫技人员1100余人、高级职称180人。
　　年门诊量85万人次，出院病人4.7万人次，住院手术1.5万台次。目前拥有双源CT、核磁共振、DSA、数字乳腺钼靶机及DR、直线加速器、生化免疫检测流水线与智能采血系统、气动物流、轨道物流、数字化手术室等一批高端医疗设备与设施。
　　全院设置临床、保健、医技科室46个，骨科为省级临床重点专科，骨科、肿瘤内科为市级临床重点学科，普外科、神经外科、肿瘤内科、神经内科、呼吸内科、消化内科、心血管内科、儿科、麻醉科等为市级临床重点专科。大力推进“智慧医疗”建设，已建成医院信息集成平台，实现移动诊疗、移动护理。开展互联网+医疗行动，实行门诊、住院“诊间结算一卡通”服务模式。
　　医院在不断深化内部人事分配制度等改革的同时，积极推进县级公立医院综合改革试点任务，探索县、镇、村一体化医疗联合体建设，先后组建了“医联体”影像诊断中心、临床检验和病理诊断中心，诊断报告结果实时传输反馈，实现医联体内医疗信息互联互通，检查检验结果互认。坚持挂大靠强，主动接轨沪宁，先后与复旦大学附属中山医院、上海瑞金医院、省人民医院、东南大学附属中大医院、省肿瘤医院等城市大医院建立协作关系，成立4个专科诊疗中心和11个名医工作室（站)，有力促进了城市优质医疗资源下沉，方便群众就医。
专科设置：
1.建湖县人民医院南院区：
　　心血管内科、呼吸内科、神经内科、消化内科、肿瘤科、骨科、心胸外科、胃肠外科、肝胆外科、泌尿外科、神经外科、甲乳外科、肾脏内科、内分泌科、介入与血管科、烧伤科、ICU、康复科、疼痛科、风湿免疫科、血液内科、中医科、眼科、耳鼻咽喉科、血液净化中心、放疗中心等专科（病区）
2.建湖县人民医院老院区（妇幼保健院）:
　　产科、妇科、儿科、口腔科、皮肤科、康复科、中医科、全科医学科、感染科等专科（病区），普通内、外科；心内科、呼吸内科、神经内科、内分泌科、消化内科、风湿肾脏科、血液科等专科门诊；儿童保健门诊、妇女保健门诊、计划生育门诊、婚检、孕前优生健康检查、预防接种门诊、心理门诊、司法鉴定所等。